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縣管水體水污染防治
太平溪人工溼地及關山人工溼地維護管理。
水污染許可證(文件)審查核發。
海洋環境清潔維護。
土壤及地下水品質監測相關業務。
飲用水相關業務。
加水站水源許可證(文件)審查核發。
河川水質監測、檢驗相關業務。
毒性及關注化學物質管理。
環境用藥(含病媒防治業)管理。
綜理空氣污染防制與噪音管制業務
固定污染源稽查管制業務
餐飲業暨紙錢集中焚燒輔導業務
游離輻射與非游離輻射業務
電動機車推廣業務
空品淨化區推廣業務
卑南溪河川揚塵防制宣導業務
街道揚塵洗街業務
空氣品質管理業務
空氣品質惡化應變業務
室內空氣品質管理業務
機車定期檢驗及裁處業務
機車汰舊換新補助業務
柴油車排煙管制及動力站維護管理業務
營建工程稽查管制業務
低碳永續家園建構業務
一般噪音及航空噪音管制區管制業務
營建工程空污費申報結算業務
機車排氣稽查管制業務(含停車怠速熄火與機車噪音檢測)
廢棄物管理規劃及執行業務。
推動垃圾減量、資源回收、廢食用油回收再利用、巨大廢棄物回收再利用工作、廚餘多元再利用等業務。
督導各鄉鎮市公所轄管垃圾衛生掩埋場操作營運管理工作。
廢棄物處理場(廠)營運之管理 (含焚化廠、廚餘及巨大回收再利用中心)。
環境衛生業務
環境教育業務
環境影響評估業務
環保文件申請綜合業務
總務業務
稽查勤務規劃
稽查人員教育訓練
違反環保法規案件之舉報及裁處
受理舉發案件之陳情與訴願
收繳罰款
強制執行之行政移送
受理民眾檢舉違反廢清法業務獎金核發
違規張貼小廣告之稽查取締及斷話業務
公害糾紛處理等事項